新型冠状病毒专题
庞德钦, 周艳萍, 杨安纳, 周以斯, 杨洁, 杨东升, 吴杰, 王泽鋆, 郭靖, 申硕
目的 建立特异性鉴别新型冠状病毒Beta株灭活疫苗原液的逆转录PCR法(reverse transcription PCR, RT-PCR)并验证。 方法 在新型冠状病毒Beta株刺突蛋白(spike,S)受体结合域(receptor binding domain,RBD)中3个特异性突变位点的上下游保守区域设计引物S3F/S3R,通过RT-PCR扩增843 bp目的DNA。对扩增产物进行测序,与原型株的S基因序列进行对比,通过3个特征突变识别Beta株。对该方法的重复性、专属性、耐用性和灵敏度进行验证。 结果 该方法能准确扩增出843 bp目的DNA,经测序表明,扩增引物与新型冠状病毒Beta株基因序列一致,包含3个特征突变位点。取1批Beta株原液进行6次PCR,测序结果显示与Beta株核苷酸序列一致。S3F/S3R引物只对S的RBD区域有扩增作用。Beta株原液4 ℃和-70 ℃放置8周,仍然可以扩增出目的条带,且测序结果正确。将原液提取RNA稀释成不同浓度后进行RT-PCR,得出最低检测限为0.032 ng/µl。结论 建立的RT-PCR具有良好的专属性、重复性、耐用性和灵敏度,能成功区分新型冠状病毒原型株与Beta株,可用于新型冠状病毒疫苗生产中疫苗原液的鉴别。