国际生物制品学杂志-栏目: 疫苗研究 栏目: 疫苗研究 https://www.ijbiol.com zh-cn https://www.ijbiol.com/CN/current.shtml https://www.ijbiol.com 5 <![CDATA[柯萨奇病毒B组5型病毒蛋白1生物信息学与线性B细胞抗原表位预测分析]]> https://www.ijbiol.com/CN/abstract/abstract13457.shtml 目的 对柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5, CV-B5)的病毒蛋白1(viral protein 1, VP1)进行生物信息学分析,以期为后续免疫监测、表位疫苗设计和疾病研究提供科学依据。方法 应用ProtParam、SignalP-6.0、DeepTMHMM-1.0、NetPhos-3.1、NetNGlyc1.0、SOPMA、SWISS-MODEL、ABCpred、BCPred和IEDB在线网站预测分析VP1的物理化学性质、结构特征和线性B细胞抗原表位。结果 CV-B5 VP1是不稳定且呈碱性的亲水性蛋白,无信号肽结构,有1个跨膜结构域。预测该蛋白可能存在33个磷酸化位点和15个糖基化位点。VP1二级结构以无规则卷曲为主,存在多个潜在的优势B细胞抗原表位。结论 利用生物信息学工具对CV-B5 VP1进行预测分析,初步判断了VP1的生物学功能及线性抗原表位。]]>